Chemiker im Grid

Während es früher Spezialisten vorbehalten war, komplexe molekulare Simulationen durchzuführen, gehören solche Rechnungen heute zum Standardrepertoire der meisten synthetisch oder ingenieurwissenschaftlich arbeitenden Wissenschaftler. Häufig untermauern theoretische Rechnungen experimentelle Arbeiten. Jedoch erweist sich der Umgang mit den Programmen für molekulare Simulationsrechnungen wegen der zu Grunde liegenden Theorien als schwierig. Oft sind mehrere Programme notwendig. Aufwendigere Rechnungen erfordern den Zugang zu Hochleistungsrechnern.

Mosgrid unterstützt innerhalb einer Grid-Infrastruktur (siehe Kasten S. 138) die Domänen Quantenchemie, Molekulardynamik und Docking.¹ Anwender können komplexe Berechnungen durchführen, ohne die genaue Eingabesyntax der bereitgestellten Programme zu kennen oder die Ergebnisse der Berechnungen aus den oft langen Ausgabedateien zu extrahieren. Einfache Berechnungen, aber auch komplexere Folgen von Einzelrechnungen werden dabei in Form von Workflows zugänglich, die das Mosgrid-Konsortium oder erfahrene Nutzer erzeugen und modifizieren können. Als Ergebnis der Berechnungen stehen dann die Ausgabedateien der verwendeten P

Blickpunkt