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Raps-Transkriptom-Datenbank | Etwa ein Drittel der über 100 000 Rapsgene ist nun einem der beiden Subgenome zugeordnet. Auch Isoformen wurden unterschieden. Dazu nutzten Tong Chaobo und Team am Oil Crops Research Institute der Chinese Academy of Agricultural Sciences in Wuhan eine Isoform-Sequenziertechnik langer Fragmente. Eine RNA-Sequenzierung der Transkripte erlaubt zudem, gewebespezifische Expressionsmuster zu kartieren. Damit ist das Genom leichter gezielt zu verändern.Raps hat eine komplexe Genetik: das Genom von Brassica napus ist ein Allopolyploid, das aus der Hybridisierung von B. rapa (ArAr) und B. oleracea (CoCo) hervorgegangen ist. Da sich diese Subgenome sehr ähneln, gab es bisher kein praxistaugliches Transkriptom von B. napus.Plant Journal 2020, 103(2), 843Rolf Schmid, <a href="https://bio4business.eu" target="_blank">bio4business.eu</a>Was bestimmt, welche Art Zelle entsteht | Pionierfaktoren sind Transkriptionsfaktoren, die an kompakte, unzugängliche Bereiche des Erbguts binden und dort inaktive Gene einschalten. Obwohl die Faktoren Ascl1 und Myod1 im Mauserbgut an größtenteils überlappenden Erkennungssequenzen binden, wirken sie unterschiedlich, wie ein Forscherteam nun zeigte: Ascl1 schaltet bevorzugt Gene ein, die in Nervenzellen benötigt werden, und Myod1 aktiviert solche, die im Muskel benötigt werden. Nach den Ergebnissen bestimmen die Bindung an die DNA und Cofaktoren gemeinsam die Spezifität der Pionierfaktoren.Nat. Cell. Biol. 2020, doi: 10.1038/s41556–020–0490–3E. coli verwandelt CO2 in Ameisensäure oder Methanol | Wissenschaftler in Potsdam-Golm haben Gene in vier Modulen in das Bakteriengenom von E. coli eingefügt, damit dieses CO2 als Energiequelle nutzt. Das erste Modul bestand aus drei Genen aus Methylobacterium extorquens, das zweite und dritte aus drei beziehungsweise zwei in E. coli natürlich vorkommenden Genen und das vierte aus einem Gen des Pseudomonas-sp.-Bakteriums. Durch die ersten zwei Module kann E. coli Ameisensäure in Glycin und Serin umwandeln, durch das dritte ist Pyruvat das Produkt des Synthesewegs, und das vierte Modul stellt Energie für das Zellwachstum bereit.Nat. Chem. Biol. 2020, doi: 10.1038/s41589-020-0473-5Cyanobakterien produzieren Öl | Wie Forscher der Universität Bonn zeigen, stellen Cyanobakterien, auch Blaualgen genannt, Öl her. Bislang hatten Wissenschaftler geglaubt, dass dies nur Pflanzen können. Die Forscher fanden ein Gen für eine Acyltransferase, das der Erbanlage für das Ölsyntheseenzym in Pflanzen wie Raps ähnelt. Nach ihren Ergebnissen stammt ein Teil der Ölsynthesemaschinerie in den Chloroplasten der Pflanzen vermutlich aus Cyanobakterien.Cyanobakterien sind näher mit E. coli verwandt als mit einem Olivenbaum.Proc. Nat. Acad. Sci. USA 2020, doi: 10.1073/pnas.1915930117Eliza Leusmann

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Über Gene, Zellen und Bakterien

Raps-Transkriptom-Datenbank | Etwa ein Drittel der über 100 000 Rapsgene ist nun einem der beiden Subgenome zugeordnet. Auch Isoformen wurden unterschieden. Dazu nutzten Tong Chaobo und Team am Oil Crops Research Institute der Chinese Academy of Agricultural Sciences in Wuhan eine Isoform-Sequenz...

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